История в фильме "Ученик" развёртывается вокруг обычного молодого парня Веньямина, который находится в непростом подростковом возрасте и ему очень сложно справляться с жизненными ситуациями. У него происходит борьба с внутренним миром, которая происходит практически у всех людей его возраста. Из-за того, что он не может разобраться со своим миром он прибегает к помощи библии и это окунает его в её мир. В мире, котором он пытается изучить все её аспекты. Это все приводит его к удовлетворению потребностей, и он понимает, что это то, что он искал долгое время. Но при этом его затягивает так сильно, он понимает, что просто становится фанатиком. И все, что находится с ним рядом, он не замечает, и того, что с ним происходит, а одному ему очень сложно будет справиться со сложившейся ситуацией. На помощь парню приходит лишь Елена Львовна, которая смогла увидеть, что с парнем происходит что-то не то. Будучи атеисткой, она преподавала в школе биологию и пыталась донести всем подросткам информацию о сексуальном влечении, которое происходит у девушек с парнями. Обладая очень чувствительной натурой и хорошим образованием, она не пытается уберечь детей от саморазрушения. Поэтому она вызывается помочь Веньямину с его проблемами. А для этого ей будет необходимо набраться терпения и хорошей выдержкой.